青年研究员

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邮箱：chenli_imib@fudan.edu.cn

地址：复旦大学2号交叉学科楼C7015室

个人简介

陈立博士2013年获北京大学化学学士学位，2019年获美国普林斯顿大学化学博士学位，2019-2020年于普林斯顿大学Lewis-Sigler Institute任博士后研究员，2020年底加入复旦大学代谢与整合生物学研究院，任青年研究员。

陈立博士从事代谢组学及代谢流的实验和生物信息学研究多年，主要工作成果包括：1）结合代谢组学实验原理与网络优化算法，提出了全局化标注非靶向代谢组学数据的新策略，为发现和标注新代谢物提供有力的工具（Nature Methods, 2021）；2）基于代谢组学和同位素示踪方法，揭示出细胞内新的叶酸和NADPH代谢通路的调节机制（Nature Metabolism, 2019）；3）借助蛋白结构和代谢组学的分析，揭示出受昼夜节律调控的蛋白Nocturnin的实际作用底物为NADP(H)，并纠正了此前十多年将Nocturnin认为是腺苷酸水解酶的认知（Nature Communication, 2019）。

主要研究方向

课题组研究以代谢核心，致力于开发代谢组学及代谢流新方法，并交叉融合分子生物学、质谱技术和多组学技术，结合大数据和生物信息学分析，以在人类代谢相关疾病的基础研究与临床转化中取得突破。主要研究方向包括：

• 基于代谢组学大数据的代谢通路研究，最大化的利用代谢组学中各代谢物的信息，实现更高效、准确的代谢通路分析；

• 稳定同位素示踪技术的代谢流方法开发，定量监测关键代谢反应通路的活性；

• 小分子辅酶因子（如NAD，叶酸，硫胺素等）在代谢通路中的作用机制研究，为代谢性疾病的发生和发展机制研究提供新思路。

本课题组竭诚欢迎对化学生物学、代谢生物学、质谱技术、生物信息学等感兴趣的同学报考研究生或参与本科生科研，并招收具有以上背景的优秀科研助理和博士后。我们将提供优越的学术训练环境并支持个人职业发展，期待你的加入。

代表性成果

1. Chen L, Lu W, Wang L, Xing X, Chen Z, Teng X, Zeng X, Muscarella A D, Shen Y, Cowan A, McReynolds M R, Kennedy B J, Lato A M, Campagna S R, Singh M, Rabinowitz J D. Metabolite Discovery through Global Annotation of Untargeted Metabolomics Data. Nat Methods 2021, 18 (11), 1377–1385. https://doi.org/10.1038/s41592-021-01303-3.

2. Chen L, Zhang Z, Hoshino A, Zheng H,D, Morley M, Arany Z, and Rabinowitz J D. NADPH production by the oxidative pentose-phosphate pathway supports folate metabolism. Nature Metabolism, 2019, 1: 404-415.  https://doi.org/10.1038/s42255-019-0043-x.

3. Estrella M* ,Du J*, Chen L*, Rath S, Prangley E, Chitrakar A, Aoki T, Schedl P, Rabinowitz J, and Korennykh A. The Metabolites NADP+ and NADPH are the Targets of Circadian Protein Nocturnin (Curled). Nature Communication, 2019, 10, 2367. https://doi.org/10.1038/s41467-019-10125-z.  (*Co-first author)

4. Jang C, Chen L, Rabinowitz J D. Metabolomics and isotope tracing. Cell, 2018, 173, 822-837. https://doi.org/10.1016/j.cell.2018.03.055.

5. Zhang Z*, Chen L*, Liu L, Su X, Rabinowitz J D. Chemical Basis for Deuterium Labeling of Fat and NADPH. J Am Chem Soc, 2017, 139, 14368-14371. https://doi.org/10.1021/jacs.7b08012. (*Co-first author)

6. Chen L, Ducker G S, Lu W, Teng X, Rabinowitz J D. An LC-MS chemical derivatization method for the measurement of five different one-carbon states of cellular tetrahydrofolate. Anal Bioanal Chem, 2017, 409, 5955-5964. https://doi.org/10.1007/s00216-017-0514-4.