青年研究员
陈立

青年研究员

电话:021-31242090

邮箱:chenli_imib@fudan.edu.cn

地址:复旦大学2号交叉学科楼C7015室

 

 


个人简介

本科毕业于北京大学化学专业,2013年赴美国普林斯顿大学攻读化学博士学位,2019-2020年于普林斯顿大学Lewis-Sigler Institute任博士后研究员。陈立博士从事代谢组学及代谢流的实验和生物信息学研究多年, 包括同位素示踪技术和基于网络优化的代谢组学数据分析等,在实验设计、方法开发和数据分析上具有丰富的经验,并取得多项成果。主要工作成果包括,基于代谢组学和同位素示踪方法,揭示出细胞内新的叶酸和NADPH代谢通路的调节机制(Nature Metabolism, 2019);在Cell的综述文章中,总结了代谢组学的研究流程和基于同位素示踪的代谢通路活性测定方法(Cell,2018);借助蛋白结构和代谢组学的分析,揭示出受昼夜节律调控的蛋白Nocturnin的实际作用底物为NADP(H),并纠正了此前十多年将Nocturnin认为是腺苷酸水解酶的认知(Nature Communication, 2019)。

主要研究方向

致力于应用代谢组学及代谢流研究,交叉融合分子生物学,质谱技术,生物信息学和多组学方法,以在人类代谢相关疾病的基础研究与临床转化取得突破。主要研究方向包括:

1) 代谢生物学:以代谢组学和代谢流研究为中心,结合分子生物学和多组学方法,研究肥胖、糖尿病、脂肪肝等代谢性疾病的发生和发展机制。

2) 代谢组学数据平台与生物信息学:建立标准化的代谢组学平台和数据库,打通和融合实验室和临床样本的代谢组学数据,用于大数据和生物信息学分析,以指导实验室和临床研究。

本课题组竭诚欢迎对化学生物学、代谢生物学、质谱技术、生物信息学等感兴趣的同学报考研究生或参与本科生科研,并招收具有以上背景的优秀科研助理和博士后。我们将提供优越的学术训练环境并支持个人职业发展,期待你的加入。

代表性成果

  1. Chen L, Zhang Z, Hoshino A, Zheng H,D, Morley M, Arany Z, and Rabinowitz J D. NADPH production by the oxidative pentose-phosphate pathway supports folate metabolism. Nature Metabolism, 2019, 1: 404-415.

  2. Estrella M* ,Du J*, Chen L*, Rath S, Prangley E, Chitrakar A, Aoki T, Schedl P, Rabinowitz J, and Korennykh A. The Metabolites NADP+ and NADPH are the Targets of Circadian Protein Nocturnin (Curled). Nature Communication, 2019, 10, 2367. (*Co-first author)

  3. Jang C, Chen L, Rabinowitz J D. Metabolomics and isotope tracing. Cell, 2018, 173, 822-837.

  4. Zhang Z*, Chen L*, Liu L, Su X, Rabinowitz J D. Chemical Basis for Deuterium Labeling of Fat and NADPH. J Am Chem Soc, 2017, 139, 14368-14371. (*Co-first author)

  5. Chen L, Ducker G S, Lu W, Teng X, Rabinowitz J D. An LC-MS chemical derivatization method for the measurement of five different one-carbon states of cellular tetrahydrofolate. Anal Bioanal Chem, 2017, 409, 5955-5964.

  6. Ducker G S, Chen L, Morscher R J, Ghergurovich J M, Esposito M, Teng X, Kang Y, Rabinowitz J D. Reversal of Cytosolic One-Carbon Flux Compensates for Loss of the Mitochondrial Folate Pathway. Cell Metabolism, 2016, 23, 1140-1153.