复旦大学代谢与整合生物学研究院以“双一流”建设为契机，建设全球顶尖的“代谢与整合生物学”研究机构为目标，推动代谢研究与细胞、生化、遗传、免疫、神经、生殖、发育、数理、工程以及临床研究等生命科学核心领域的交叉与整合研究，力争实现代谢及相关领域基础生物学研究的原创理论突破，同时在人类代谢相关疾病的基础研究与临床转化方面取得突破。

研究院与复旦大学生命科学学院、医学院、复旦附属医院、国外知名代谢研究院长期合作，以人类、模式动植物和微生物为研究对象，以代谢与遗传及发育的交叉研究为突破口，探讨代谢物感知和信号转导机制并揭示其对生命活动的调控机制，研究生物代谢过程的发生和发展机制。聚焦如下主攻方向与关键科学问题：1.代谢调控的分子和细胞生物学机制；2.代谢稳态调控与疾病发生；3.代谢研究新技术、新方法及临床转化。